二手基因測序儀 是測序產(chǎn)業(yè)鏈的起點(diǎn)也是關(guān)鍵環(huán)節(jié),它為整個(gè)中下游測序服務(wù)提供基本的測序支撐,同時(shí)也處于基因測序產(chǎn)業(yè)價(jià)值鏈頂端?;驕y序儀對于基因產(chǎn)業(yè)的重要性,如同發(fā)動(dòng)機(jī)之于汽車行業(yè),芯片之于電子通信行業(yè)。
基因測序也稱DNA測序,是現(xiàn)代生物學(xué)研究中重要的手段之一?;驕y序技術(shù)經(jīng)過了三個(gè)發(fā)展階段。
一代測序:指雙脫氧末端終止法,擴(kuò)增后通過毛細(xì)管電泳讀取序列,每次獲取數(shù)據(jù)量少。
二代測序:為高通量測序,采用微珠或高密度芯片邊合成邊測序,代表有454,Solexa,SOLID,高通量,可一次獲得數(shù)G數(shù)據(jù),相對與第三代,都仍然需要擴(kuò)增的方法放大信號,擴(kuò)增后再檢測。
三代測序:特點(diǎn)是單分子測序,多基于納米科技,無需擴(kuò)增,對單分鏈DNA/RNA直接用合成、降解、通過納米孔等方源式直接測序,核心特點(diǎn)是無需擴(kuò)增所以成本更低。
二手基因測序儀 二代技術(shù)中有哪些品牌突出?有哪些性能優(yōu)勢?
Roche公司的454測序平臺、Illumina公司的Solexa測序系統(tǒng)以及ABI公司的SOLID測序系統(tǒng)標(biāo)志著二代測序技術(shù)誕生。盡管各系統(tǒng)在高通量水平、測序準(zhǔn)確度、存儲格式、技術(shù)方法上各有差異,但共同特征是大大降低了測序成本并大大地提高了測序速度,完成一個(gè)人的基因組測序只需一周左右時(shí)間。然而二代測序技術(shù)在測序前要通過PCR段對待測片段進(jìn)行擴(kuò)增,增加了測序的錯(cuò)誤率。而且二代測序產(chǎn)生的測序結(jié)果長度較短,需要對測序結(jié)果進(jìn)行人工拼接,因此比較適合于對已知序列的基因組進(jìn)行重新測序,而在對全新的基因組進(jìn)行測序時(shí)還需要結(jié)合一代測序技術(shù)。
簡而言之: Roche 454是焦磷酸測序; illuminaSolexa是合成法測序; ABI SOLID是連接法測序。
就讀長來看: Roche 454 > illuminaSolexa > ABI SOLID。
就Reads數(shù)來看: ABI SOLID > illuminaSolexa > Roche 454。
就應(yīng)用來看: Roche 454讀長較長,便于拼接 ,因此在denovo測序方面有很大優(yōu)勢;ABISOLID雖然讀長很短,但是Reads數(shù)多,而且ABI的雙色球編碼技術(shù),使得每個(gè)堿基都會被讀取兩遍,準(zhǔn)確率很腐, 因此ABISOL心在檢測SNP、轉(zhuǎn)錄組測序、ChIP-Seq等方面很有優(yōu)勢;illuminaSolexa的讀長和Reads數(shù)均位于中間,比較適合于基因組重測序。而在實(shí)際應(yīng)用中 ,由千Roche454成本太商,因此illuminaSolexa 也被較多的應(yīng)用于denovo測序。